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Foi testado um kit comercial de extração de ADN (DNeasy Plant Mini Kit, Qiagen) de acordo com as instruções do fabricante. Este revelou produzir melhores resultados do que os métodos tradicionais!
Os extratos de ADN, dependendo do método de extração e do tipo de amostra, podem conter contaminantes e restos celulares que potencialmente poderão inibir as reações de PCR. Como resultado de ADN com contaminantes, poucos ou nenhuns fragmentos de ADN serão amplificados comparados com o que seria expectável quando usando ADN de elevada qualidade (Ng e Tan, 2015).
Usar quantidades de ADN inconsistentes em reações de PCR irá resultar em concentrações inconsistentes de produtos amplificados de PCR, afetando a intensidade das bandas entre amostras (Ng e Tan, 2015).
Na maioria dos casos, métodos convencionais de extração de ADN são suficientes para produzir ADN de boa qualidade. No caso de os métodos convencionais nãos serem suficientes, os kits comerciais para purificação/extração de ADN ajudam a melhorar ou obter ADN de melhor qualidade (Ng e Tan, 2015).
No caso do Connect.gene foram usados Kits comerciais uma vez que os métodos tradicionais não resultaram em ADN de qualidade suficiente para serem usados em análises futuras. Esta situação está relacionada essencialmente com dois fatores:
As espécies Angelica lignesncens e Lactuca watsoniana apresentam naturalmente, mesmo no material vegetal jovem, vilosidades, ceras que comprometem o resultado final usando métodos tradicionais de extração. Para Isoetes azorica e Trichomanes speciosum, por serem espécies mais arcaicas foi também decidido recorrer aos kits comercias de extração para garantir que potenciais contaminantes seria melhor eliminados.
Relativamente ao Vaccinium cylindraceum e Picconia azorica a época de colheita não coincidiu com a época de rebentação foliar das mesmas, por motivos de logística não foi possível esperar por a época mais favorável à colheita, e sendo assim o material colhido, no estado adulto, apresenta folhas cutinizadas que influenciam o produto final.
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